《规程》共八章34条，通过重构评价体系、优化管理流程、下放评审权限等方面，构建起“以成果为导向、以效能为核心”的科技计划项目全周期管理机制。

《规程》明确，将专项经费100万元（含）以下项目的综合绩效评价权力下放至盟市科技局、自治区部分直属高校院所、国家驻区科研单位，将前置审核权限下放，改为后置审核备案，不断放宽科研项目的管理权限。对专项经费300万元（含）以上项目，由专业机构会同科技厅主管业务处室组织开展综合绩效评价。在受理与审查方面，《规程》明确项目牵头单位需在项目实施期满3个月内提出综合绩效评价申请。相较于原《规程》，进一步明确科技报告的审核时间为15个工作日、提前申请综合绩效评价的时限为提前时间不超过项目实施周期的1/3，将原评前审查修改时间由30天缩短至15天。

《规程》将综合绩效评价评分标准分为优秀、良好、合格的项目，综合绩效评价结论为通过；评分不合格的项目，结论为不通过。其中与成果及成果转化相关评分指标占绩效目标完成的百分比提高至50%，更加突出以成果为导向的综合绩效评价。提出暂缓形成综合绩效评价结论的条件以及综合绩效评价结论为“结题”的情形。明确结余资金使用范围，项目综合绩效评价结论为“通过”的，其结余资金按规定留归项目承担单位使用，统筹用于科研活动的直接支出。