一是重点实验室实行依托单位领导下的主任负责制，对人财物实施统一管理。同时规定了重点实验室主任每届任期五年，连任不超过两届，主任每年在重点实验室工作时间一般不少于八个月，取消了主任职称及学位限制，年龄也放宽到60周岁。

二是学术委员会作为重点实验室的学术指导机构，职责是审议重点实验室的发展目标、研究方向、重大学术活动、年度工作等。其中规定了学术委员会人数范围为“7-13人单数”，取消了“一位专家不得同时担任三个以上实验室的学术委员会委员”的要求。

三是重点实验室同样要重视科学普及，每年向社会公众特别是学生群体开放不少于5天的时间。同时还要加大对科研仪器及科学数据开放共享力度及扩大共享范围。

四是重点实验室更要加强与本领域、本行业的协同创新，推进科技成果转化。